Sul finire del XVIII secolo giungono anche nelle Marche le nuove idee dell'illuminismo, portate dalle armi dell'esercito del generale Bonaparte. Queste nel 1796 sconfiggono l'esercito pontificio e, dopo aver creato l'effimera Repubblica Anconetana, nel marzo 1798, fanno confluire i territori occupati in un unico corpo, nei confini del precedente Stato Pontificio.
Vengono istituiti, sul modello francese, dipartimenti nominati secondo il fiume principale che li attraversa. Pergola fa parte di quello del Metauro (con Ancona come capoluogo) ed è uno dei quindici cantoni. Il nostro distretto è quello di Senigallia (Sinigaglia), con Fano e Corinaldo.
La
Repubblica Romana avrà vita breve. Già l'anno dopo l'esercito austriaco ristabilirà l'autorità papale, scacciando le truppe
giacobine.
Moneta da due baiocchi "repubblicana" battuta della zecca di Pergola nel 1798
