Dopo la breve esperienza della Repubblica Romana, Napoleone istituisce nelle Marche e nell'Italia nord-orientale un regno, conseguenza della trasformazione imperiale della Francia.
Pergola, come gran parte della regione, viene tolta alla Chiesa il 2 aprile 1808. Milano diviene la capitale e il regno è suddiviso in sei Divisioni Territoriali e in dipartimenti legati al fiume principale che li attraversa.
Alla caduta di Napoleone, anche questa organizzazione statale terminerà, e il nostro territorio tornerà ancora una volta sotto lo Stato Pontificio, fino al 1861.
